明清时期[编辑]主条目:香港明朝历史和香港清朝初期历史1514年(明朝正德九年)葡萄牙派兵抵达并攻占屯门,明军于1521年(正德十六年)向葡萄牙开战,史称屯门海战,最后完全全胜。
清朝初年,香港属新安县管辖。清廷为防沿海居民接济南明遗臣郑成功,遂于1662年(康熙元年)下令迁海,加上实施海禁,香港本区受严重影响。后来广东巡抚王来任、广东总督周有德请求复界,1669年(康熙八年)朝廷允许驰禁,原有宗族陆续迁回,外来宗族亦应广东省政府的鼓励乘势迁入,当中包括福建、江西及广东惠州、梅州等客家籍农民,新界宗族分布的新局面逐渐形成[40][41]。